اسهال صبحگاهی ممکن است به دلیل شرایط موقتی مانند بارداری یا عفونت ایجاد شود. اگر به طور مکرر اتفاق بیفتد، اسهال صبحگاهی ممکن است نشانه یک مشکل سلامتی مانند IBS باشد. یک دفعه مدفوع شل در صبح طبیعی است. اما زمانی که  اسهال صبحگاهی  به طور منظم در یک دوره چند هفته ای رخ می دهد، زمان تشخیص مشکل فرا رسیده است.

ممکن است اسهال صبحگاهی داشته باشید بدون اینکه در غیر این صورت احساس تهوع داشته باشید و علائم دیگری نداشته باشید. اما علاوه بر  مدفوع شل  و اجابت مزاج مکرر، علائم دیگری ممکن است شامل موارد زیر باشد:درد  یا  گرفتگی شکمتهوع و استفراغتبنفخخون در مدفوعاگر اغلب اسهال صبحگاهی را تجربه می کنید  ، مهم است که علت آن را کشف کنید. این می تواند نشانه ای از یک مشکل مزمن سلامتی، مانند  سندرم روده تحریک پذیر (IBS) باشد . یا ممکن است یک عفونت باکتریایی داشته باشید یا صرفاً یک الگوی غذایی داشته باشید که باید تغییر کند.