نشان داده شده است که خوردن یک رژیم غذایی کم کربوهیدرات باعث کاهش وزن، کنترل قند خون و حساسیت به انسولین از جمله مزایای دیگر می شود. با این حال، تأثیر رژیم‌های کم کربوهیدرات بر کلسترول لیپوپروتئین با چگالی کم (LDL) همچنان یک نگرانی قابل توجه برای بسیاری از پزشکان است و برخی از آنها را از توصیه این رژیم‌های بالقوه مفید باز می‌دارد. مطالعات علمی تایید می‌کنند که رژیم‌های کم کربوهیدرات و کتوژنیک کلسترول LDL را برای افراد معمولی مبتلا به دیابت نوع 2 یا چاقی افزایش نمی‌دهند. در عوض، افرادی که از رژیم‌های کم کربوهیدرات پیروی می‌کنند معمولاً شاهد افزایش کلسترول لیپوپروتئین با چگالی بالا (HDL) همراه با کاهش تری گلیسیرید، کلسترول باقیمانده غنی از تری گلیسیرید و ذرات کوچک LDL هستند.

یک مطالعه حتی کاهش کلی ذرات LDL را نشان داد. با این حال، این نتایج نشان دهنده میانگین شرکت کنندگان در مطالعه است. برخی از افراد ممکن است افزایش چشمگیر LDL خود را تا بیش از 50٪ مشاهده کنند و به عنوان یک واکنش دهنده بیش از حد LDL در نظر گرفته شوند. جمعیت های خاص، مانند ورزشکاران لاغر، ممکن است حتی بیشتر در معرض افزایش سطح LDL باشند.