نتایج تحقیقات علمی اخیر نشان می‌دهد که مصرف غذاهای فوق فرآوری‌شده می‌تواند با کاهش چشمگیر سطوح سلامتی مرتبط باشد. مصرف مداوم این نوع مواد غذایی به‌طور بالقوه می‌تواند خطر ابتلا به بیماری‌های مزمن و جدی مانند سرطان ریه، دیابت نوع ۲ و بیماری‌های التهابی روده (IBD) را افزایش دهد. این یافته‌ها بر اهمیت توجه به کیفیت رژیم غذایی و اجتناب از محصولاتی تأکید دارند که ماهیت طبیعی مواد اولیه خود را از دست داده‌اند. اخیراً، مطالعات متعددی به بررسی ارتباط میان رژیم‌های غذایی التهاب‌زا، به‌ویژه آنهایی که حاوی مقادیر زیادی از غذاهای فوق فرآوری‌شده هستند، با بدتر شدن وضعیت سلامت پرداخته‌اند.

برای نمونه، برخی از پژوهش‌ها ارتباط مستقیمی میان مصرف بالای این غذاها و افزایش خطر ابتلا به نوعی از بیماری التهابی روده به نام کرون را نشان داده‌اند. همچنین، تحقیقات دیگری حاکی از آن است که افزایش مصرف غذاهای فوق فرآوری‌شده می‌تواند ریسک ابتلا به سرطان ریه را تا ۴۱ درصد در افراد بالا ببرد. تعریف و طبقه‌بندی غذاهای فوق فرآوری‌شده با وجود اجماع علمی رو به رشد در خصوص مضرات غذاهای فوق فرآوری‌شده، سازمان استاندارد مواد غذایی (Food Standards Agency) تصریح می‌کند که هنوز یک تعریف واحد و مورد تأیید جهانی برای این گروه از مواد غذایی وجود ندارد. با این حال، متداول‌ترین و پرکاربردترین تعریف مورد استفاده در پژوهش‌های بین‌المللی از طبقه‌بندی NOVA نشئت می‌گیرد.