وقتی صحبت از پروبیوتیک‌ها می‌شود، معمولاً اولین چیزی که به ذهن می‌رسد سلامت دستگاه گوارش است. اما ارتباط گسترده میان میکروبیوم روده و سایر سیستم‌های بدن باعث شده پژوهشگران بررسی کنند که آیا برخی پروبیوتیک‌ها می‌توانند بر سیستم ایمنی، سلامت قلب و متابولیسم، خلق‌وخو و عملکرد مغز نیز اثر بگذارند یا خیر. شواهد موجود نشان می‌دهد که بعضی سویه‌های پروبیوتیکی ممکن است در این زمینه‌ها فوایدی داشته باشند؛ اما یک نکته بسیار مهم وجود دارد: اثر پروبیوتیک‌ها به‌شدت وابسته به سویه، مقدار مصرف، ترکیب محصول و ویژگی‌های فرد مصرف‌کننده است. بنابراین نمی‌توان نتیجه یک مطالعه درباره یک سویه خاص را به تمام مکمل‌های پروبیوتیک تعمیم داد.

۱. ممکن است به عملکرد سیستم ایمنی کمک کنند روده و سیستم ایمنی ارتباط بسیار نزدیکی با یکدیگر دارند. بخش قابل‌توجهی از سلول‌های ایمنی بدن در اطراف دستگاه گوارش قرار دارند و سد روده نیز یکی از بخش‌های مهم تعامل بدن با محیط خارج محسوب می‌شود. برخی پروبیوتیک‌ها ممکن است از طریق کمک به حفظ سد روده و تعدیل پاسخ‌های ایمنی، بر عملکرد سیستم ایمنی اثر بگذارند.